2014年醫(yī)院獲得達芬奇手術機器人和TOMO放療系統(tǒng)兩項甲類配置證，其中泌尿外科達芬奇手術量全國三甲。卒中中心入選國家示范中心，卒中中心、胸痛中心、創(chuàng)傷中心通過省建設單位驗收，胸痛中心成為的南京地區(qū)胸痛中心質(zhì)控單位，房顫中心被授予首批中國房顫中心及房顫中心示范基地，心衰中心通過全國首批心衰中心認證。為全省孕產(chǎn)婦急危重癥救治指導中心和全省應急緊急醫(yī)學救援基地。許多醫(yī)療技術如嚴重脊柱畸形治療、間質(zhì)干細胞治療免疫性疾病、小切口治療復雜心臟疾病、大血管大手術、干細胞修復子宮內(nèi)膜、生殖醫(yī)學、移植技術、機器人手術、內(nèi)鏡診療等技術水平居于全國前列并在區(qū)域形成引領。

把握南京大學“雙一流”建設和南京市創(chuàng)新名城建設的契機，做好與學校院系的深層次對接，加快基礎與臨床研究的高度融合。近年來獲得國家杰出青年基金、優(yōu)秀青年基金等科研項目870余項，近年來榮獲國家科技進步二等獎3項，省科學技術一等獎10項，中華醫(yī)學獎18項，其他省科學技術獎40余項，共計各類科技成果300余項，一大批代表性文章發(fā)表在主流期刊上。Nature出版集團自然指數(shù)排名全國第5位、江蘇第1位。在科技部2017年中國科技論文統(tǒng)計中，鼓樓醫(yī)院SCI論文發(fā)表數(shù)全國第28位，上升8位；作為第一作者國際合著論文發(fā)表數(shù)第20位，上升17位。2014年以來，鼓樓醫(yī)院與美國霍普金斯合作，共同開展國際化標準化住院醫(yī)師規(guī)范化培訓。2018年入選國家教學培訓示范中心。

醫(yī)院落實公立醫(yī)院改革任務，醫(yī)藥價格綜合改革運行平穩(wěn)順利，藥占比連續(xù)多年位居全省較低水平。成為全省新農(nóng)合醫(yī)院管理專家成員單位。鼓樓醫(yī)院以擔當社會責任為突破口，不斷彰顯醫(yī)院公益性。1996年組建大型醫(yī)院集團——南京鼓樓醫(yī)院集團，目前包括19家醫(yī)療單位。2015年以來，醫(yī)院與30家基層醫(yī)療單位和社區(qū)衛(wèi)生服務中心建立了區(qū)域協(xié)同的醫(yī)療合作模式。醫(yī)院借助集團平臺、對口支援平臺、南京市暨鼓樓醫(yī)院遠程醫(yī)學會診中心、南京遠程影像診斷中心平臺等，幫助受援醫(yī)院全面提升綜合水平，使當?shù)厝罕姷玫搅藢嵒?。在鼓樓醫(yī)院幫扶下，2018年高淳人民醫(yī)院晉級三級醫(yī)院，宿遷市人民醫(yī)院通過晉級三甲醫(yī)院。

醫(yī)院圓滿完成H7N9禽流感防治、蘇州爆炸傷員救治、青奧會醫(yī)療保障等各項應急保障任務。醫(yī)院與美國、德國、澳大利亞、日本等國家和地區(qū)建立交流合作，醫(yī)護人員志愿到非洲等地開展幫扶合作，彰顯鼓醫(yī)人文博愛。2018年由鼓樓醫(yī)院10人參加的第27期援桑醫(yī)療隊圓滿完成赴桑給巴爾1年的援外醫(yī)療工作任務回到國內(nèi)，被國家衛(wèi)健委授予“全國援外醫(yī)療工作先進集體”。

2004年以來鼓樓醫(yī)院在全國創(chuàng)新性開展人文醫(yī)院建設的研究與實踐，提出“建設全優(yōu)質(zhì)研究型人文醫(yī)院”的目標。2007年建成國內(nèi)知名的西醫(yī)院歷史紀念館，被定為江蘇省對外文化交流基地、南京市愛國主義教育基地。2012年南擴新大樓正式啟用，充分彰顯人性化、現(xiàn)代化、智能化、精細化理念。醫(yī)院連續(xù)多年位居全省三級醫(yī)院患者滿意度前列，被評選為全省群眾滿意的醫(yī)療機構。

醫(yī)院先后被評為全國醫(yī)院管理年先進單位、全國文明單位、優(yōu)質(zhì)護理服務考核優(yōu)秀醫(yī)院、衛(wèi)生系統(tǒng)先進集體、城市醫(yī)院文化建設先進集體、衛(wèi)生系統(tǒng)行業(yè)作風建設先進集體、有突出貢獻先進集體、醫(yī)院改革創(chuàng)新獎等百余項獎項和榮譽。醫(yī)院新大樓榮獲世界建筑新聞獎和魯班獎。2015年榮獲中國醫(yī)院管理團隊獎，2016年榮獲中國研究型醫(yī)院建設示范單位、全國改善醫(yī)療服務示范醫(yī)院、全國醫(yī)院后勤管理創(chuàng)新先進單位、全國公共機構節(jié)能示范單位等。

2017年榮獲國家衛(wèi)生計生委“2015-2017年進一步改善醫(yī)療服務行動計劃”示范醫(yī)院、示范科室、示范個人等榮譽。2018年在全省首家通過了HIMMS 6級評審及HIMMS 7級初審，入選全國首批建立健全現(xiàn)代醫(yī)院管理制度試點醫(yī)院，成為中國醫(yī)院品質(zhì)管理聯(lián)盟組織的多維管理工具應用示范醫(yī)院，優(yōu)質(zhì)研究型人文醫(yī)院建設案例榮獲首屆全國醫(yī)管精典案例運營管理獎，三元聯(lián)動安寧療護工作模式榮獲亞洲醫(yī)院管理卓越獎。