東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院前身為創(chuàng)建于1935年的中央大學(xué)醫(yī)學(xué)院，其后歷經(jīng)南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院、中國人民解放軍第五軍醫(yī)大學(xué)、南京鐵道醫(yī)學(xué)院等重要時期，2000年4月并入東南大學(xué)。經(jīng)過幾代人的奮斗，醫(yī)學(xué)院現(xiàn)已發(fā)展成為東南大學(xué)培養(yǎng)醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)精英人才的重要基地。學(xué)院培養(yǎng)了一大批科學(xué)家、教育家及各行各業(yè)的杰出人才，他們?yōu)樽鎳尼t(yī)學(xué)與生命科學(xué)教育和醫(yī)藥衛(wèi)生事業(yè)作出了巨大貢獻，其中，中國科學(xué)院院士賀林、楊煥明、樊嘉為學(xué)院八十年代培養(yǎng)的畢業(yè)生。

2012 年，我校獲批為全國第一批卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃項目試點高校，承擔(dān)了拔尖創(chuàng)新醫(yī)學(xué)人才培養(yǎng)模式改革試點和五年制臨床醫(yī)學(xué)人才培養(yǎng)模式改革試點兩個項目，2016年順利通過教育部臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)認證。作為教育部重點建設(shè)綜合性大學(xué)的醫(yī)學(xué)院，堅持精英教育和培養(yǎng)卓越醫(yī)師的理念，遵循醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)人才培養(yǎng)的規(guī)律，以一流的理論教學(xué)和臨床實習(xí)條件，多層次的國際化學(xué)習(xí)環(huán)境，致力于培養(yǎng)具有扎實醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)基礎(chǔ)，有國際化視野和人文情懷的創(chuàng)新型醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)專業(yè)人才。

學(xué)院擁有一支以學(xué)術(shù)造詣較深的專家教授為龍頭、中青年骨干教師為主體、結(jié)構(gòu)優(yōu)良的教學(xué)科研隊伍。有一大批從國外歸來或引進的年富力強的學(xué)科帶頭人和獲國內(nèi)著名高校博士學(xué)位的中青年骨干教師。現(xiàn)有“長江學(xué)者獎勵計劃”特聘教授1名；國家杰出青年基金獲得者4名；國家自然科學(xué)基金優(yōu)秀青年基金獲得者1名；國家“973”首席科學(xué)家2名；教育部新世紀優(yōu)秀人才8名；江蘇省特聘教授2名；江蘇省“333”工程和“青藍工程”學(xué)術(shù)帶頭人和優(yōu)秀骨干教師30多名；國家、省部級“有突出貢獻”的中青年專家多名。教師中有高級職稱300多人，其中博士生導(dǎo)師70余人，碩士生導(dǎo)師200多人，有20多人次分別擔(dān)任全國及省部級醫(yī)學(xué)雜志的主編、副主編及編委等職務(wù)，20多人次擔(dān)任各類中華醫(yī)學(xué)會各專業(yè)學(xué)會主委、副主委和委員等（如中華醫(yī)學(xué)會重癥醫(yī)學(xué)專業(yè)委員會主委邱海波、中華醫(yī)學(xué)會放射學(xué)會副主委滕皋軍等）。聘請了包括多名院士在內(nèi)的國內(nèi)外著名專家30多人為兼職教授。目前全日制在校生2200人，其中本科生1300人，碩士生700人，博士生200人。2006年我院首開東南大學(xué)整建制招收學(xué)位留學(xué)生先河，當(dāng)年招收MBBS臨床醫(yī)學(xué)留學(xué)生60人，現(xiàn)有在校留學(xué)生400余人。

醫(yī)學(xué)院擁有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)博士3個一級學(xué)科博士授權(quán)點，臨床醫(yī)學(xué)為省級重點學(xué)科，醫(yī)學(xué)技術(shù)為省優(yōu)勢學(xué)科。目前臨床醫(yī)學(xué)、生物學(xué)與生物化學(xué)、藥理學(xué)與毒理學(xué)、神經(jīng)科學(xué)與行為科學(xué)等4個學(xué)科已進入ESI全球前1%。各學(xué)科經(jīng)過長期積累，圍繞醫(yī)學(xué)影像、放射介入、重癥醫(yī)學(xué)、腎臟病學(xué)、腫瘤、神經(jīng)精神疾病、器官纖維化等已經(jīng)形成特色鮮明的重點研究方向，在國內(nèi)具有重要影響力。

學(xué)院的研究工作以轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)為特色、醫(yī)工結(jié)合，開展多層次、多方位交叉研究，取得了豐碩的成果。近年來獲得國家“973”牽頭項目2項（首席），國家重點研發(fā)計劃牽頭項目2項、“國家杰出青年基金”項目4項，國家“973”二級課題、“863”計劃10余項，國家自然科學(xué)基金重點項目、重大國際合作項目、面上項目150余項，省部級項目100余項。近三年獲得國家科技進步二等獎1項，中華醫(yī)學(xué)一等獎1項，教育部自然科學(xué)/科技進步一等獎3項，江蘇省科技進步獎10項。近三年發(fā)表SCI論文300余篇，申請并獲得授權(quán)專利30多項。

學(xué)院國際化教育走在前列，先后與美國、德國、法國、英國、瑞典等多家國際著名醫(yī)學(xué)機構(gòu)和大學(xué)建立了穩(wěn)定的教學(xué)、科研合作關(guān)系。學(xué)院特別重視在國際合作環(huán)境中培養(yǎng)具有國際視野的優(yōu)秀學(xué)生，每年約近20%的學(xué)生有機會到國外著名醫(yī)院進行為期1-3個月的臨床實習(xí)和游學(xué)交流。2013年獲得國家留學(xué)基金委資助公派本科生出國實習(xí)及研學(xué)項目,每年選派10名本科同學(xué)赴德國漢堡大學(xué)、慕尼黑工業(yè)大學(xué)和瑞典烏普薩拉大學(xué)進行為期3-6個月的臨床實習(xí)或畢業(yè)設(shè)計。

2016年“中德臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)學(xué)位人才培養(yǎng)項目”獲國家留學(xué)基金委研究生創(chuàng)新人才培養(yǎng)項目資助，每年選派10名臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)學(xué)位碩士畢業(yè)生，赴德國漢堡大學(xué)和烏爾姆大學(xué)攻讀博士學(xué)位，“中瑞合作雙博士學(xué)位臨床醫(yī)學(xué)拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)試點”項目于2018年獲批準(zhǔn)資助，每年選派5名學(xué)生赴瑞典烏普薩拉大學(xué)，通過中瑞合作，獲中方瑞方雙學(xué)位博士。目前我院共有來自美國、新西蘭、印度、巴基斯坦、也門、布隆迪、尼日利亞、喀麥隆等40個國家的400多名留學(xué)生，就讀本科與研究生。學(xué)院已形成了從本科生、碩士生、博士生、博士后到留學(xué)生的一整套人才培養(yǎng)體系。近年來我院每年有30名左右本科生和研究生獲得國家留學(xué)基金委資助赴國外一流大學(xué)攻讀博士、碩士學(xué)位，其中包括美國哈佛大學(xué)、耶魯大學(xué)、哥倫比亞大學(xué)、斯坦福大學(xué)、約翰霍普金斯、倫敦帝國理工學(xué)院、多倫多大學(xué)、德國慕尼黑工業(yè)大學(xué)等世界一流名校進行深造。

醫(yī)學(xué)院以精英教育的理念，實行一體化培養(yǎng)，配備學(xué)習(xí)型和研究型導(dǎo)師，發(fā)揚優(yōu)良辦學(xué)傳統(tǒng)，充分利用綜合性大學(xué)理、工、醫(yī)、文、經(jīng)管等多學(xué)科交叉和教學(xué)科研資源優(yōu)勢，著力培養(yǎng)基礎(chǔ)扎實、知識面寬、能力強、素質(zhì)高、適應(yīng)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)發(fā)展和社會需求的高層次、高素質(zhì)臨床醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)方面的精英人才和領(lǐng)軍人物。2016年，由學(xué)院本科生組成的代表隊獲得第七屆全國高等醫(yī)學(xué)院校大學(xué)生臨床技能競賽華東分區(qū)賽團體特等獎和第七屆全國高等醫(yī)學(xué)院校大學(xué)生臨床技能競賽總決賽團體二等獎； 2013年獲得第十三屆大學(xué)生“挑戰(zhàn)杯”特等獎，2014年獲“創(chuàng)青春”全國大學(xué)生創(chuàng)業(yè)大賽公益創(chuàng)業(yè)類全國銀獎，2016年獲“創(chuàng)青春”全國大學(xué)生創(chuàng)業(yè)大賽公益創(chuàng)業(yè)類全國金獎兩項。近年來研究生就業(yè)率99.5%，本科生就業(yè)率98.9%，非七年制學(xué)生讀研率為34%，一大批優(yōu)秀本科生被免試保送到北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院、北京大學(xué)、解放軍總醫(yī)院、復(fù)旦大學(xué)、北京師范大學(xué)、上海交通大學(xué)、浙江大學(xué)、中科院等國內(nèi)著名高校、醫(yī)療單位讀研，七年制優(yōu)秀學(xué)生有機會享受國家公派留學(xué)項目到國外大學(xué)攻讀博士學(xué)位。